Les arbres d’agrumes dans une saison favorable vont pousser par vagues successives, au printemps, en début d’été et souvent encore en début d’automne.

La taille se pratique en fin d’hiver, avant la première poussée de croissance du printemps.

En d’autres périodes la taille ne sert qu’en cas d’incident, branche cassée ou endommagée.

On peut cependant couper en toutes saisons une branche qui gène le passage ou la récolte, sans que l’arbre n’en souffre

Pendant les trois premières années après la plantation, le jeune arbre a besoin d’agrandir sa surface foliaire pour une croissance rapide. Pour cette raison il ne faut pas encore éliminer les branches basses et buissonnantes à la base de l’arbre. Bien sur il faut par contre enlever, dés qu’elles apparaissent, toutes les pousses en dessous du point de greffe.

L’arbre doit aussi se ramifier et s’élargir. Pour cela, seulement les branches les plus longues de la couronne, le haut de l’arbre, seront raccourcies d’un tiers environ, de moitié si elles sont très longues.

Pendant ces trois années on n’élimine pas encore des branches complètes et on laisse l’arbre croitre un peu sauvage et gagner du volume et de l’amplitude librement.

A partir de la 4ème année, un arbre bien nourri et irrigué sera établi, avec un système racinaire complet et une canopée fournie. Selon les variétés, il sera parfois buissonnant et touffu, un peu anarchique, mais il a maintenant une force suffisante pour supporter la taille de formation.

On va d’abord nettoyer le tronc des branches basses (au dessus du point de greffe) sur une hauteur de 60/80 cm pour les arbres bas (par exemple mandariniers), ou 1 mètre à 1,20 mètre pour les arbres plus grands (pomelo, yuzu). On peut parfois laisser deux troncs principaux lorsqu’ils s’écartent et divergent suffisamment, voire exceptionnellement trois. Mais si l’arbre est planté près d’un mur ou d’un abri, ne laissez pas un tronc se développer dans cette direction.

Coupez les branches au ras du tronc, avec un sécateur propre et pour les plus grosses avec une scie bien aiguisée. Pour éviter de déchirer l’écorce lorsqu’une grosse branche se détache, sciez la d’abord à 30 centimètres du tronc. Sciez ensuite le tronçon restant au ras du tronc.   

Il faut maintenant éliminer complètement les branches au centre de l’arbre.  L’idéal est lui donner une forme ouverte pour laisser la lumière entrer au coeur de la couronne, avec les branches principales qui s’élargissent vers l’extérieur et un centre dégagé. Il ne faut pas hésiter à couper les branches qui poussent droit au milieu et s’élèvent verticalement, elles peuvent mobiliser toute l’énergie de l’arbre et empèchent la lumière de pénétrer dans la canopée. A partir du tronc on ne va laisser que trois à 5 branches principales, dans des directions divergentes.

Enlevez les branches secondaires qui se croisent. Lorsque l’arbre grandira elles vont inévitablement s’abimer par frottement.
Enlevez aussi toutes les branches qui pointent directement vers le centre de l’arbre.

Les branches restantes, principales ou secondaires ne doivent pas être raccourcies

Il ne sera pas forcément utile de tailler un jeune arbre d’agrumes tous les ans, tant qu’il garde une forme assez équilibrée. Si nécessaire il faut enlever les branches jeunes verticales et trop vigoureuses (gourmands), si elles commencent à occuper le centre de la couronne. Nettoyer aussi le tronc des repousses et enlever ou raccourcir les branches qui se croisent pour éviter des dommages. 

Il faut éliminer surtout et toujours les pousses du porte-greffe (en dessous du point de greffe) dés qu’ils apparaissent, donc en toutes saisons. Ces branches à éliminer se reconnaissent à leur feuillage différent.

Il est difficile de maintenir longtemps une forme à coupelle ouverte pour un arbre d’agrumes. A moins qu'il ne s'agisse d'une plantation à but commercial, avec l'obligation de faciliter une récolte rapide, l'effort requis ne se justifie pas. Pour les arbres d’agrumes plantés en pleine terre dans un jardin privé, les interventions par la taille deviennent exceptionnelles lorsqu’ils ont atteint leur pleine maturité.

Les arbres de basse stature, comme les mandariniers, vont vite former une canopée ronde, le centre rempli par les ramifications des branches principales extérieures. C’est leur forme naturelle, adaptée à une bonne production de fruits. Comme indiqué, seuls les gourmands centraux verticaux et les repousses du porte-greffe sont à éliminer.

Les arbres plus grands comme les yuzus ou pomélos vont se développer en hauteur en s’élargissant, avec une couronne en parasol. If faudra juste éliminer d’éventuels gourmands à la base et sur le tronc.

Pour les arbres d’agrumes en pleine maturité la taille consiste seulement à intervenir en cas d’incident, comme raccourcir une branche brisée avant qu’elle n’abime l’écorce.
En cas de dégats du gel sur les jeunes pouses et les branches auxilliaires, il faut éliminer à la fin de l'hiver toutes les parties endommagées et noircies.